Žádné osobě jedoucí vlakem do Ústí nad Labem bezesporu neunikl stavební ruch v ústeckém železničním uzlu. Tato modernizace odstartovala 20. června 2005 ve výhybně Ústí nad Labem jih a potrvá do listopadu 2008.
      Během ní dojde ke kompletní sanaci spodku a obnově svršku trati, sanaci Mariánské skály, rekonstrukci většiny železničních mostů, k výstavbě nového centrálního stavědla, z nějž bude po skončení stavebních prací řízen provoz všech tří modernizovaných dopraven (Ústí n.L. jih, hlavní nádraží a sever) a výstavbě nového ostrovního nástupiště ve stanici Ústí nad Labem sever o délce 140 metrů.
    Avšak z pohledu cestujících budou nejvýznamější stavební práce probíhající na hlavním nádraží. Stávající podchod pod nástupišti bude rozšířen o obchody a protažen až na labský břeh, kde vznikne parkoviště se 100 místy. Současně s rekonstrukcí kolejiště stanice dojde k rekonstrukci všech tří nástupišť. Jako první bylo zrekonstruováno první nástupiště (od 1. února do 31. října 2006), po němž následuje třetí nástupiště (od 31. října 2006 do 14. května 2007). Jako poslední bude rekonstruováno nástupiště číslo dvě (od 14. května do konce roku 2007). První nástupiště bylo v rámci rekonstrukce prodlouženo na délku 226 metrů a třetí nástupiště na 410 metrů.
    Rekonstrukce druhého nástupiště, která potrvá do konce roku 2007, si vyžádá největší dopravní omezení na hlavním nádraží. Přilehlá kolej u prvního nástupiště je (z důvodu návazných úprav děčínského zhlaví stanice) dočasně kusá a umožňuje tak pouze příjezd a odjezd vlaků ve směru Teplice v Čechách. Z důvodu chybějící spojovací koleje od/do Teplic ke třetímu nástupišti budou vlaky jedoucí z Děčína do stanice Ústí nad Labem západ (a obráceně) vedeny úvraťově přes výhybnu Jih. Přístup na třetí nástupiště bude cestujícím umožněn na děčínském zhlaví stanice přechodem přes kolejiště z prvního nástupiště.
    Rekonstruovaná nástupiště jsou vybavena novým zastřešením a novým informačním systémem, který je instalován i v hale. Celá rekonstrukce železničního uzlu si vyžádá investiční náklady ve výši 2,5 miliardy Kč.